Dansk dokumentarserie. Når ens krop ikke passer til ens indre, starter en lang og smertefuld rejse for at få lov til at være og blive set som den man er. I Født i den forkerte krop følger vi tre modige transkønnede, der er i gang med at transformere sig fra ét køn til det modsatte og forvandle sig til dem, de virkelig er. Miko på 17 blev født som pige, men lever i dag som dreng. Han føler, at hans familie accepterer hans valg - lige bortset fra hans far, som har svært ved at forstå, at hans lille pige er blevet til en dreng. Miko drømmer inderligt om at få fjernet sine bryster, men har hidtil fået nej til en operation. Nu har Mikos søster måske fundet en løsning på Mikos problem, og hun håber, at det også vil give ham modet til at få talt ud med sin far om de svære følelser. Maia på 26, der er psykologistuderende, og født som dreng, har gennemgået en voldsom hormonkur for at blive til den pige, hun føler sig som. Men i hendes ansigt er der stadig tydelige tegn på, at hun engang var et andet køn. Maia opsøger en specialist i håb om at få fjernet sit skæg permanent. Lotte på 51, der er født som mand, finder i en sen alder og efter flere forliste forhold ud af, at hun vil leve som kvinde. I fem år har hun kæmpet for at få lov til at gennemgå en kønsskifteoperation, og nu får hun endelig svar på, om lægerne vil hjælpe hende til også fysisk at blive den, hun i virkeligheden er.