Inkvisitionen hærger blandt de konverterede spanske jøder, og mange tilstår under tortur ikke at være 'rigtigt' omvendte. Hovedstaden i Det osmanniske Rige, Konstantinopel, bliver et fristed for de sefardiske jøder. Fra det 16. århundrede og til i dag har et stort jødisk samfund levet i fred og fordragelighed med deres islamiske naboer. Jøderne fra Nord- og Mellemeuropa, kaldet Ashkenazi-jøderne, flygtede til Polen og skabte her en blomstrende, jødisk kultur i storbyer og i de små landsbyer, shetl. Jøderne blev så godt integreret i det polske samfund, at de overtog den polske adels klædedragt, der den dag i dag bliver båret af de ortodokse hassidim-jøder. Hele denne kultur blev tilintetgjort, da nazisterne under Anden Verdenskrig dræbte mere end tre millioner polske jøder. I 1600-tallet drev utallige pogromer de ukrainske jøder til Holland, der skulle være et fristed. Det var det også lige indtil 1940, da landet blev besat af tyskerne, som tvang jøderne til at identificere sig ved at bære en gul Davidsstjerne (Davidstern).